Gemi soğutma sistemlerinde en sık karşılaşılan sorunlar arasında gaz kaçağı, kompresör arızaları ve yetersiz soğutma performansı bulunur. Bu tür problemler, genellikle bakım eksikliğinden veya hatalı kullanım kaynaklıdır. Erken fark edilmeyen arızalar, hem yüksek maliyetli onarımlara hem de operasyonel gecikmelere sebep olabilir. Düzenli kontrol ve uzman servis desteği, bu sorunların önüne geçmenin en etkili yoludur. Özellikle limanlarda gerçekleştirilen planlı bakım çalışmaları, uzun vadede büyük avantaj sağlar.